Jde o komplexní kondensační děj, který využívá některých enzymových systémů
citrátového cyklu. Klíčovou reakcí je štěpení isocitrátu za vzniku sukcinátu a glyoxylátu (OHC-COO
-); ten v dalším kroku kondenzuje s aktivovaným acetylem. U rostlin a některých mikroorganismů slouží k synthese
oxalacetátu (prekursoru biosynthesy sacharidů procesem
glukogenese) z dvouuhlíkatých štěpů (
acetyl-CoA), získaných nejčastěji
β-oxidací mastných kyselin. Protože živočichové tento cyklus nemají, nemohou z
mastných kyselin, uvolněných z
lipidů, synthetisovat sacharidy.