enzymy umožňující přechod dvouřetězcové DNA z jednoho prostorového uspořádání do druhého, a to tak, že přeruší vlákno DNA, umožní daný přechod a vlákno opět spojí. DNA-topoisomerasy typu I přerušují pouze jeden řetězec, DNA-topoisomerasy typu II (tzv. gyrasy) přerušují oba řetězce a spojují je za účasti ATP. DNA-topoisomerasy se uplatňují zejména při replikaci DNA a při změnách nadšroubovicového pnutí cyklické DNA (plasmidů apod.).